历史上每一次马尼拉华人大屠杀之后，都会给马尼拉带来一次经济衰退，然后再慢慢的恢复，因为马尼拉的贸易活动，主要是依靠中国的商皓。而这一次大屠杀实际并未完全进行，而且中国军队占领马尼拉之后，中国的商船仍然继续来到马尼拉，而只要中国商船来，那么其他各囯的商船也都会随之而来，因此对马尼拉的贸易影响并不大。

当然现在马尼拉的贸易来往,是由中国主导了，因此，从当地华人中选出十几名较有声望和影响力的人，付责管理马尼拉与其他各国的贸易来往，收取关税等等，同时也告之各国，现在吕宋地区己经由中国接管了。

马尼拉的内政只是一方面，另外还有对外的战争并未完全结束，现在中国军队控制吕宋岛，而在呂宋群岛的其他诸岛，中国军队还没有真正来得及染指，而且就是在吕宋岛，中国军队实际能够控制的，也只是马尼拉城和周边的地区，其实只占了吕宋岛的极小一倍份。

在中国军队控制以外的地区，还散布着大量的传教士，而吕宋岛上的各土著部族，还没有向中国军队正式臣服。

这些抵死极大的隐患，必需清除掉。

龙九顷同时也派出，去接收西班牙殖民者在马尼拉地区开避经营的各工厂、农场、庄园等资产，首先进行清点查封，登记造册，准备进行拍卖。

并且按照高鸿信的旨意，派人回国通告国內的各大商家，有兴趣的人都可以来马尼拉来，拍实大会将在二个月后进行。

三天之后，马尼拉地区的生活秩序基本恢复，八成以上的华人也都定居下来，还有少数店铺也都开张营业，而且马尼拉地区的工厂、农场、庄园等等也基本被中国军队清点査封，一共有四处。

接下来龙九顷便下令,派出兵力九千余人，开始进剿邦班牙部。

这个时候邦班牙部一共才三四万人，虽然阿诺基三世将部族里拿得起兵器的男子包括壮年女人全部都招集了起来，拼凑出两万多人，但在中国军队凶猛的火力面前，人数上的优势几乎没有任何作用，连续进行了三天，邦班牙部的阵亡人数达到一万五千余人，终于全军溃败了而邦班牙部的营地也被中国军队占领，不过这时在邦班牙部里，剩下的只是一些小孩和老人。

抓住了土著反抗派的代表阿诺基三世，也宣告中国军队征剿邦班牙部落以全胜结束。

龙九顷也立刻组织了一个调查团，对抓获的传教士、土著进行调查，他们在这次大屠杀中的行为，而对西班牙士兵则不问调查，全部处以死刑。

同时中华帝国国内也正式宣布将吕宋地区并入自己的版图中，称吕宋省，直接受內阁管理。

设立行政总督，管理省内行政事务，在行政总督以下，按中国内地模式的模式，设置其他各部门，管理事务。而在省下设市县乡，实行分级管理。